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☆特許翻訳のDNA☆

特許庁の標準技術集「核酸の増幅及び検出」を英訳していきます。

ご訪問ありがとうございます

特許庁の標準技術集より
核酸の増幅及び検出」
を1行ずつ英訳していきます。

皆様からご教授いただければ幸いです。

 

原文へのリンクはこちら

 ↓↓↓

出典/引用:
標準技術集「核酸の増幅及び検出」(特許庁)
1-1 プローブ・プライマーとして適した配列の選択方法

0032

さらに、制限酵素は直鎖DNA末端ぎりぎりであると認識しないので、認識する配列の外側にも余分な配列を付加する。

【訳案1】
An additional redundant sequence is also added to the primer so as to be outwardly adjacent to the sequence to be recognized, since the restriction enzyme cannot recognize a sequence located just near a terminal of a linear DNA fragment.
【訳案2】
An additional redundant sequence is also provided on the outer side of the sequence to be recognized: otherwise, the restriction enzyme cannot recognize the target sequence since the target sequence is located too close to a terminal of a linear DNA fragment.

0031

付加することができる配列
(1)PCR産物をベクターに挿入する際、二つのプライマーに制限酵素が認識する配列を付加しておかねばならない。

【訳案】
Sequence to be added
(1) When a PCR product is inserted into a vector, a sequence that can be recognized by a restriction enzyme has to be added to each of two primers.

【用語】
ベクター: vector [ Vector (molecular biology) - Wikipedia ]
制限酵素: restriction enzyme; restriction endonuclease [ Restriction enzyme - Wikipedia ]

まとめ 1-1-C

長さの調整

    (1)長さとは、この場合、プローブ・プライマーの設計に適したDNA断片の塩基数をさす。

    (2)前項の図2から分かるように、オリゴヌクレオチドの塩基数が多ければ多いほどTmは上昇する。したがって、PCRに使用するプライマーの設計の際、Tmを低すぎず、高すぎずという値に設定しなければならない。Tmは塩基数だけで決定できるものではないが、おおよその塩基数とTmの相関は前項の図に示されており、点線で囲まれた範囲のものがPCRには適しているので、これを参考にGC含量を調整する。なお、この表がなくてもTmを計算予測する経験則が確立されている(出典/参考資料3)。

    (3)プライマーの設計上、長さは15~30塩基程度、望ましくは20~25塩基が適当である。この長さだと鋳型DNAとの特異的なアニーリングが十分だからである。通常DNA合成機で化学合成される。長いと特異性が増すと思われるが、それは誤解でプライマーのTmがアニーリング温度よりも高くなってしまうため、ミスマッチを許した偽ハイブリダイゼーションが増加し、結局、特異性が低下してしまうので注意を要する。一方、短くてもミスマッチが多くなる結果となる(出典/参考資料2)。

    (4)ヒトゲノムの遺伝子総量は30億塩基対だから、単純に計算すると17mer(4の17乗の組み合わせ)まではヒトの遺伝子のどこかに同様な配列が存在する可能性があり、その辺りで特異性が出てくる。ただし、一般的には20mer前後のプライマーがよく使われている(出典/参考資料2)。

 

【訳案】

Adjustment of length

     (1) The term "length" as used herein refers to the number of bases in a DNA fragment suitable for designing a probe primer.

    (2) As can be seen from Fig. 2 in the preceding section, the Tm increases as the number of bases in an oligonucleotide increases.  An appropriate Tm should be selected in designing a primer for a PRC reaction.  Although the Tm depends not exclusively on the number of bases, there is a certain correlation between the number of bases and the Tm.  The correlation is roughly illustrated in Fig. 2 in the preceding section.  Tm values in a range enclosed by a dashed line are suitable for the PCR.  The G-C content may be adjusted in accordance with the data.  Calculation or estimation of the Tm may rely not necessarily on this table; some empirical rules have been established (see Reference material 3).

    (3) The appropriate length of a primer in design is on the order of 15 to 30 bases, desirably 20 to 25 bases, since this length allows the primer to specifically anneal to a template DNA.  The primer and the template DNA are chemically synthesized, typically with a DNA synthesizer.  Note: Although a longer primer seemingly increases the specificity, the specificity decreases in fact since the Tm of the primer is higher than the annealing temperature, increasing a degree of so-called pseudohybridization due to mismatching.  A short primer also may cause significant mismatching (see Reference material 2).

    (4) Since approximately 3 billion base pairs constitute genes in the human genome, there can be two same sequences in the genes for up to 17-mer primers, which has 4^17 combinations, according to a simple calculation.  17-mer or more primers may provide a reliable specificity.  Primers having a length of approximately 20-mer are typically used (see Reference material 2).

0030

ただし、一般的には20mer前後のプライマーがよく使われている(出典/参考資料2)。

【訳案】
Primers having a length of approximately 20-mer are typically used (see Reference material 2).

0029

(4)ヒトゲノムの遺伝子総量は30億塩基対だから、単純に計算すると17mer(4の17乗の組み合わせ)まではヒトの遺伝子のどこかに同様な配列が存在する可能性があり、その辺りで特異性が出てくる。

【訳案1】
(4) Genes in the human genome contain approximately 3 billion base pairs in total.  This means that two same sequences can exist somewhere in the human genes for up to 17-mer (i.e., 4^17 combinations) according to a simple calculation.  An optimal specificity can thus be achieved around 17-mer.
【訳案2】
(4) Since approximately 3 billion base pairs constitute genes in the human genome, there can be two same sequences in the genes for up to 17-mer primers, which has 4^17 combinations, according to a simple calculation.  17-mer or more primers may provide a reliable specificity.

【用語】
ヒトゲノム: human genome

【翻訳メモ】
4の17乗: four to the seventeenth power; the seventeenth power of four

0028

一方、短くてもミスマッチが多くなる結果となる(出典/参考資料2)。

【訳案1】
A short primer also may cause significant mismatching (see Reference material 2).
【訳案2】
An increased number of mismatch sites are observed also for a shorter primer (see Reference material 2).

0027

長いと特異性が増すと思われるが、それは誤解でプライマーのTmがアニーリング温度よりも高くなってしまうため、ミスマッチを許した偽ハイブリダイゼーションが増加し、結局、特異性が低下してしまうので注意を要する。

【訳案1】
Note: Although a longer primer seemingly increases the specificity, the specificity decreases in fact since the Tm of the primer is higher than the annealing temperature, increasing a degree of so-called pseudohybridization due to mismatching.
【訳案2】
Note: A common error is to assume that the specificity increases as the length of the primer increases. A longer primer may have a Tm that is higher than the annealing temperature, which allows mismatches to occur so that a degree of so-called pseudohybridization increases. This results in a reduced specificity.

0026

通常DNA合成機で化学合成される。

【訳案】
The primer and the template DNA are chemically synthesized, typically with a DNA synthesizer.

【用語】
DNA合成機: DNA synthesizer

0025

(3)プライマーの設計上、長さは15~30塩基程度、望ましくは20~25塩基が適当である。この長さだと鋳型DNAとの特異的なアニーリングが十分だからである。

【訳案1】
(3) A primer, in its design, has a length of approximately 15 to 30 bases, preferably 20 to 25 bases, since the primer having this length can specifically anneal to a template DNA.
【訳案2】
(3) The appropriate length of a primer in design is on the order of 15 to 30 bases, desirably 20 to 25 bases, since this length allows the primer to specifically anneal to a template DNA.
【訳案3】
(3) The primer is designed to have approximately 15 to 30 bases, preferably 20 to 25 bases in length, since this length is enough to ensure a specific annealing of the primer to a template DNA.

【用語】
鋳型DNA: template DNA

0024

なお、この表がなくてもTmを計算予測する経験則が確立されている(出典/参考資料3)。

【訳案1】
Calculation or estimation of the Tm may rely not necessarily on this table; some empirical rules have been established (see Reference material 3).
【訳案2】
It is to be noted that not only this table, but also some established empirical rules may be used to calculate and estimate the Tm (see Reference material 3).

0023

Tmは塩基数だけで決定できるものではないが、おおよその塩基数とTmの相関は前項の図に示されており、点線で囲まれた範囲のものがPCRには適しているので、これを参考にGC含量を調整する。

【訳案】
Although the Tm depends not exclusively on the number of bases, there is a certain correlation between the number of bases and the Tm.  The correlation is roughly illustrated in Fig. 2 in the preceding section.  Tm values in a range enclosed by a dashed line are suitable for the PCR.  The G-C content may be adjusted in accordance with this data.

【翻訳メモ】
[0017]-[0019]とほぼ同内容。

0022

したがって、PCRに使用するプライマーの設計の際、Tmを低すぎず、高すぎずという値に設定しなければならない。

【訳案1】
An appropriate Tm should be selected in designing a primer for a PRC reaction.
【訳案2】
The Tm should be set to a value suitable for designing a primer used for a PCR reaction.
【訳案3】
A Tm that is too high or too low for design of a primer for PCR should be avoided.

【翻訳メモ】
※前文からのつながりで、「したがって」は論理的に不明瞭。
 訳出するなら「Accordingly」でしょうか?
※「PCR」は、英語では「PCR reaction」という表現も多いようです。
 「PCR (Polymerase Chain Reaction) reaction」となって
 「reaction」が重複しているような気もしますが…。

0021

(2)前項の図2から分かるように、オリゴヌクレオチドの塩基数が多ければ多いほどTmは上昇する。

【訳案】
(2) As can be seen from Fig. 2 in the preceding section, the Tm increases as the number of bases in an oligonucleotide increases.

0020

長さの調整
(1)長さとは、この場合、プローブ・プライマーの設計に適したDNA断片の塩基数をさす。

【訳案】
Adjustment of length
(1) The term "length" as used herein refers to the number of bases in a DNA fragment suitable for designing a probe primer.